机械型：电机带动曲轴使柱塞往复运动，直接对物料进行增压。通过多组柱塞提供连续的压力，均质压力较高，产量大，但物料最小量较大，同时电机带动曲轴需要有多级减速机构，使设备效能一般且体积较大。适合用于大型生产。

液压型：电机带动油泵，通过液压系统对物料进行增压。液压系统可提供更高的压力，设备效能较高，体积相对较小，并且物料最小量更小。可同时适用于试验和生产。

2.手动型

通过手动杠杆机构对物料进行增压。由于是手动增压所以产能较低，但其具有拆装快捷，可随身携带的优势，同时需要的物料最小量很小，非常适用于进行小量试验，可以充分满足实验室的研发需求。

气动型将压缩气体的压力转化为液压。设备需要氮气瓶或压缩空气机的支持，气体的消耗量很大，并且最高均质压力普遍较低，但是由于没有单独的增压机构，所以体积较小，适合配备有空气压缩机的场所使用。

从均质腔结构原理上分类：

第一代 碰撞型

1．穴蚀喷嘴型——直接引用了高压切割和航空航天推进技术中的气蚀喷嘴结构，但是由于在超高压的作用下，物料溶液经过孔径很微小的阀心时会产生几倍音速的速度，并与阀心内部结构发生激烈的磨擦与碰撞，因此其使用寿命较短，并伴随有金属微粒残落。

2．碰撞阀体型——通过碰撞阀（Impact valve）和碰撞环（Impactring）结构的引入，降低了局部磨损，延长了均质腔的使用寿命。但是由于其根本原理上还是通过溶液中的物料和高硬度金属（如钨合金）结构碰撞，所以金属微粒的磨损残落问题没有彻底解决，并且截止到2013年，绝大多数的国产高压均质机都使用了这种结构。

第二代 对射型

1．Y形交互型——根本的区别在于其应用了对射流的原理。利用特有的Y形结构，使高压溶液中高速运动的物料自相碰撞，大大提高了腔体的使用寿命，并解决了金属微粒残落的问题。

第一代碰撞型均质腔在生产医用注射液时，残落的惰性金属颗粒有可能发生聚集或形成更大颗粒。从病理学角度看，将导致毛细血管血流减少，进而引发人体内组织的机械性损伤，以及引起急性或慢性炎症反应。对射型均质腔的诞生从原理上解决了惰性金属残落的问题。但是由于内部结构原因，当物料的浓度和粘度较大时，第二代对射型较第一代更易发生阻塞。